Garbhodakashayi, el segundo Avatar de Visnu, entra en cada una de las galaxias y luego se acuesta sobre el agua que produce de Su propio cuerpo. De su ombligo surge el tallo de un loto que se convirtió en el lugar de nacimiento de Brahma, el demiurgo y primer ser creado. Dentro del tallo de este loto están los catorce sistemas planetarios, creados por Brahma. El Señor está presente en la forma de Garbhodakashayi Visnu en cada galaxia, de la que es el sustentador. A pesar de esta presencia universal, la influencia de la energía material no puede tocarlo. A su debido tiempo, el mismo Visnu toma la forma de Siva y aniquila la creación cósmica. Estas tres encarnaciones secundarias, Brahma, Visnu y Siva, son las deidades tutelares de los tres atributos de la naturaleza material. El segundo Avatar de Visnu, Garbhodakashayi, que es adorado como el Alma Suprema, o Hiranyagarbha, y que es descrito en los himnos védicos como poseedor de miles de cabezas, se destaca como el Maestro de la galaxia, y a pesar de su presencia dentro de la naturaleza material, Él no está de ninguna manera bajo su dominio.
El tercer Avatar de Visnu, llamado Kshirodakashayi, también encarna la virtud. El Alma Suprema de todos los seres vivos, reside en el océano lechoso de la galaxia. Esta es la descripción de los Avatares Supremos dada por Chaitanya Mahaprabhu. A continuación, describe a los Lila-Avatars [Manifestaciones Divinas que en diversas ocasiones descienden a la galaxia material para hacer visibles los entretenimientos espirituales y absolutos del Señor Supremo], que se dedican a diferentes entretenimientos, y señala que su número es infinito. No obstante, el Señor representa a algunos de ellos: Matsya, Kurma, Raghunath, Nrishingha, Vamana y Varaha. Luego vienen los tres Guna-Avatars, o encarnaciones de Visnu que personifican los atributos de la naturaleza material. El primero, Brahma, se encuentra entre los seres vivos creados, salvo que su servicio devocional le otorga un gran poder. Tal ser primordial, que se convirtió en Brahma por la influencia de la pasión material, está directamente facultado por Garbhodakashayi Visnu para crear miríadas de seres vivos. Brahma es comparado con joyas preciosas iluminadas por los rayos del Sol, la estrella del día, que es similar al Señor Supremo en la persona de Garbhodakashayi Visnu. Si a cierta edad ningún ser vivo es capaz de realizar las funciones de Brahma, Garbhodakashayi Visnu mismo se convierte en Brahma y realiza las funciones asociadas a esa posición.
De manera similar, el Señor se manifiesta en la forma de Siva cuando llega el momento de aniquilar la galaxia material. Siva, a través de su contacto con Maya (la energía material), asume él mismo varias formas, generalmente once. Al no pertenecer a los seres vivos comunes, es más o menos el propio Krishna. El ejemplo de la leche y el yogur se cita a menudo en este contexto: el yogur es un producto lácteo, pero no puede sustituir a la leche. Del mismo modo, Siva es una emanación de Krishna, pero no puede desempeñar el papel de Krishna ni, como Él, darnos la oportunidad de reintegrar nuestra condición espiritual. A diferencia de Visnu, Siva vive en contacto con la naturaleza material; esto es lo que los distingue esencialmente. Siva encarna la amalgama de las tres formas de conciencia alterada, llamadas virtud, pasión e ignorancia.